В Институте работает с 1974 года после окончания физического факультета МГУ им.М.В.Ломоносова, пройдя путь от инженера до старшего научного сотрудника.

Им были предложены и рассчитаны ряд магнитных каналов и спектрометров с высоким импульсным разрешением для исследований в области пион-ядерной физики, он был координатором первого международного российско-итальянского эксперимента по образованию пионов в протон-ядерных столкновениях на линейном ускорителе Московской мезонной фабрики, результаты которого легли в основу его кандидатской диссертации. Он участвовал в создании установки КАСПИЙ в ОИЯИ (Дубна) и в экспериментах на этой установке по исследованию пион-ядерных и ядро-ядерных реакций.

Затем его основным научным интересом становится релятивистская ядерная физика – исследования модификации свойств векторных мезонов в ядерной среде, исследования фазовых переходов в ядерной среде, поиск критической точки. При его непосредственном участии в модернизации установки NA50 в ЦЕРНе был разработан и изготовлен ряд пучковых детекторов и специальный поглотитель из окиси бериллия, которые позволили существенно улучшить разрешение по массе и обнаружить эффект подавления выхода J/psi в столкновениях ядер свинца.

Ф.Ф.Губер является участником ряда международных экспериментов - NA61/SHINE и ALICE в ЦЕРНе, HADES в GSI, CBM на ускорительном комплексе FAIR в Германии.

Под его руководством защищена кандидатская диссертация.